El Servicio de Control Interno tiene como función la revisión y control de los ingresos y gastos, así como la rendición de cuentas. Dichas funciones se encuentran reguladas en el artículo 200 de los Estatutos de la Universidad de La Rioja y en el Capítulo Noveno de las Bases de Ejecución del Presupuesto.

La misión del Servicio de Control Interno como unidad administrativa es supervisar la actividad económica y financiera de la Universidad de La Rioja para garantizar:

• Que sus actos se ajustan a las disposiciones legales en la materia.
• Que se cumplen los principios de buena gestión financiera, así como una gestión trasparente de los recursos utilizados.