José Ángel Martínez González ha obtenido el grado de doctor por la Universidad de La Rioja tras la defensa de su tesis Estudio QM/MM del mecanismo y cinética de las reacciones de la Proteasa NS3 del virus de la Hepatitis C con sus sustratos principales, por la que se le concedió la calificación de sobresaliente ‘cum laude’.
Dirigida por Rodrigo Martínez y Miguel González, de la Universidad de Barcelona, es la primera tesis que aborda el estudio teórico de sistemas enzimáticos en la Universidad de la Rioja. A lo largo de este tiempo, José A. Martínez ha formado parte del grupo de Cinética y Dinámica de las Reacciones Químicas de la Universidad de La Rioja.
Esta tesis pretende dar información sobre el funcionamiento de la enzima NS3, la cual es clave en el desarrollo de la Hepatitis C. Además es un exponente de la interdisciplinaridad necesaria para llevar a cabo este tipo de estudios, ya que en ella se conjugan la biología (sistemas enzimáticos), la química (reactividad química), la física y la matemática (modelización de los sistemas).
Para ello y basándose en las metodologías desarrolladas por los doctores M. Karplus, M. Levitt y A. Warshel -por la que recientemente les fue concedido el premio Nobel de Química-, han modelizado las reacciones más relevantes que lleva a cabo esta enzima en el interior de las células hepáticas y que permiten la obtención de información que sea útil en el desarrollo de nuevos tratamientos farmacológicos.
A lo largo de esta tesis se ha realizado un estudio mediante el uso de ordenadores de la superficie de energía potencial y un estudio cinético de las reacciones de la proteasa; para ello se han utilizado los recursos informáticos que posee el grupo en las universidades de La Rioja y Barcelona, así como otras infraestructuras como el Marenostrum.
Así y gracias a esta investigación se ha conseguido describir el mecanismo por el cual reacciona la proteasa con sus sustratos principales y que forma parte del ciclo vida del virus. Este mecanismo parece ser una excepción al mecanismo general de la familia de proteasas a la que pertenece la NS3.
Además se ha realizado el primer estudio cinético, el cual ha permitido el encontrar una serie de estructuras que son de interés en el desarrollo de inhibidores de la proteasa. Esta información será de gran utilidad en la mejora de los inhibidores que ya se utilizan en la actualidad.
A lo largo de su tesis doctoral, el doctor ha realizado dos estancias de investigación: una en el Institut de Biotecnología i Biomedicina, Universidad Autónoma de Barcelona, Cerdanyola del Vallés, bajo la supervisión de la doctora Laura Masgrau; y otra en Instituto Ruder Bo¿kovic (Zagreb), bajo la supervisión de la doctora Sanja Tomic. Así mismo ha participado en numerosos congresos nacionales como internacionales.
Actualmente el doctor José Ángel Martínez se encuentra en el Grupo Computational Studies of (Bio)inorganic Systems de la Universidad Autónoma de Barcelona, continuando su formación posdoctoral y colaborando en el proyecto ‘Predicción In Silico de las Propiedades Fisicoquímicas del Polvo Interestelar de Silicatos’ bajo la supervisión del doctor Albert Rimola en el que se quiere mejorar el actual conocimiento sobre el polvo interestelar así como en la evolución de reacciones químicas en el espacio.