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Identificado un perfil transcriptómico con machine learning

Estudios sobre secuelas respiratorias de la COVID grave

Identificado un perfil transcriptómico relacionado con las secuelas respiratorias derivadas de la COVID grave.

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Un estudio liderado desde CIBERES, IRBLleida, CIBIR y Universidad de La Rioja, detecta, a través de técnicas de machine learning, un conjunto de alteraciones en la transcripción genética común a los pacientes que sufren disfunción pulmonar severa meses después de superar la infección por SARS-Cov-2

Los pacientes con secuelas respiratorias derivadas de cuadros de COVID grave presentan, meses después de superada la infección, un perfil específico de alteraciones en la transcripción genética.

Así lo demuestra un estudio liderado por investigadores del área de Enfermedades Respiratorias del CIBER (CIBERES), del Institut de Recerca Biomèdica de Lleida (IRBLleida), del Centro de Investigación Biomédica de La Rioja (CIBIR) y la Universidad de la Rioja que publica la revista Biomedicine & Pharmacotherapy.

Este panel de genes podría constituir un catálogo de biomarcadores tempranos para el manejo clínico de estas secuelas y contribuir al desarrollo de terapias personalizadas para pacientes con estas manifestaciones asociadas a la COVID persistente.

En el contexto de postpandemia actual, existe un gran número de personas aquejadas de secuelas derivadas de la COVID-19, incluyendo secuelas respiratorias.

En el ámbito clínico, no hay un consenso en cuanto al manejo de estas secuelas y no se han descrito estrategias terapéuticas específicas para estos pacientes. Por ello, es urgente avanzar en la comprensión de los mecanismos asociados a estas afectaciones para abordar potenciales tratamientos.

En este nuevo estudio, que forma parte del proyecto CIBERESUCICOVID del Instituto de Salud Carlos III (ISCIII), los investigadores CIBERES y de los grupos de investigación ‘Translational Research in Respiratory Medicine’ del IRBLleida (Lleida), ‘Biomarcadores y Señalización Molecular’ del CIBIR (Logroño) y ‘GRUPAC’ de la Universidad de La Rioja, se centraron en la búsqueda de nueva información molecular asociada a las consecuencias respiratorias de los cuadros graves de COVID-19 que cursaron con síndrome de dificultad respiratoria aguda (SDRA).

«Hasta el 80% de los pacientes que sobreviven al síndrome de dificultad respiratoria aguda secundario a la infección por SARS-CoV-2 presentan anomalías persistentes en la función pulmonar tras el alta hospitalaria. Obtener una mejor comprensión de los fundamentos moleculares que median la disfunción pulmonar persistente podría ayudar al desarrollo de terapias y biomarcadores para las secuelas posteriores a la COVID», explica David de Gonzalo, investigador del CIBERES y del IRBLleida y uno de los coordinadores de este estudio.

Con este objetivo, este equipo de investigadores se centró en identificar, mediante secuenciación del genoma completo, aquellos genes expresados de manera diferencial en estos pacientes. «El perfil transcripcional de todo el genoma constituye una poderosa herramienta para analizar la expresión génica con un enorme potencial para identificar nuevos objetivos farmacológicos, mejorar las terapias actuales y descubrir biomarcadores. Actualmente, la secuenciación de ARN (RNA-seq) se considera el estándar de oro entre las herramientas de perfilado de transcriptomas y permite descifrar procesos patológicos subyacentes a múltiples enfermedades, incluidas las respiratorias», apunta Ignacio M. Larráyoz, investigador del CIBIR y la Universidad de La Rioja y otro de los autores principales de la investigación.

En concreto, la investigación realizó el estudio del perfil transcripcional de todo el genoma a partir de muestras de sangre de una selección de 50 pacientes que estuvieron ingresados en el Hospital Universitario Arnau de Vilanova-Santa María (Lleida) con cuadros de COVID-19 graves, y a los que se les realizó una evaluación tres meses después del alta hospitalaria.

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